Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF4Q8WV16 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms