Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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C15orf40Q8WUR7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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C15orf40Q8WUR7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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C15orf40Q8WUR7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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C15orf40Q8WUR7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
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C15orf40Q8WUR7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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C15orf40Q8WUR7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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C15orf40Q8WUR7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C15orf40Q8WUR7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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