Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 FAM213A-201ENST00000372181 2058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
SVIPQ8NHG7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 BRD2-205ENST00000449085 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SVIPQ8NHG7 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms