Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ9

NGDN, Neuroguidin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGDNQ8NEJ9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NGDNQ8NEJ9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms