Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD12Q8N8I0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms