Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC155Q8N6L0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC155Q8N6L0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms