Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf62Q8N4C0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms