Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZI9

IFNL3, Interferon lambda-3, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL3Q8IZI9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNL3Q8IZI9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFNL3Q8IZI9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNL3Q8IZI9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNL3Q8IZI9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNL3Q8IZI9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNL3Q8IZI9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNL3Q8IZI9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms