Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP4Q86YS3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms