Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX20Q7Z614 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SNX20Q7Z614 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX20Q7Z614 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX20Q7Z614 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX20Q7Z614 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX20Q7Z614 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX20Q7Z614 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX20Q7Z614 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX20Q7Z614 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX20Q7Z614 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX20Q7Z614 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX20Q7Z614 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX20Q7Z614 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX20Q7Z614 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX20Q7Z614 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX20Q7Z614 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX20Q7Z614 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX20Q7Z614 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX20Q7Z614 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms