Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRC9Q6ZRR7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms