Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LRSAM1Q6UWE0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRSAM1Q6UWE0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms