Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C16orf54Q6UWD8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms