Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TTC41PQ6P2S7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC41PQ6P2S7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms