Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDE2Q6IQ49 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SDE2Q6IQ49 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms