Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIF1Q5UIP0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms