Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OTUD3Q5T2D3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms