Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUW0

KRBOX4, KRAB domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX4Q5JUW0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
KRBOX4Q5JUW0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRBOX4Q5JUW0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms