Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SOHLH1Q5JUK2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOHLH1Q5JUK2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms