Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL39P5Q59GN2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.3 ms