Protein–RNA interactions for Protein: Q53RT3

ASPRV1, Retroviral-like aspartic protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASPRV1Q53RT3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASPRV1Q53RT3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms