Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms