Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CEP55Q53EZ4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP55Q53EZ4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms