Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTXN3Q4LDR2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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