Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q499Y3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q499Y3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q499Y3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q499Y3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q499Y3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q499Y3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q499Y3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q499Y3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q499Y3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q499Y3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q499Y3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q499Y3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q499Y3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q499Y3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q499Y3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q499Y3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q499Y3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q499Y3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q499Y3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q499Y3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q499Y3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q499Y3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q499Y3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q499Y3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q499Y3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q499Y3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q499Y3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q499Y3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q499Y3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q499Y3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q499Y3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q499Y3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q499Y3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms