Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-2Q3LI61 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms