Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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CCDC142Q17RM4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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CCDC142Q17RM4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC142Q17RM4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC142Q17RM4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
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