Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CARTPTQ16568 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms