Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNAPC1Q16533 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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