Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LAMA4Q16363 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA4Q16363 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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