Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC6Q16204 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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