Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNA6Q15825 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNA6Q15825 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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