Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HMGN3Q15651 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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