Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TAF11Q15544 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms