Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TAF13Q15543 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms