Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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SYCP1Q15431 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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SYCP1Q15431 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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SYCP1Q15431 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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SYCP1Q15431 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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SYCP1Q15431 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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SYCP1Q15431 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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SYCP1Q15431 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYCP1Q15431 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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