Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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RAB39AQ14964 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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RAB39AQ14964 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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RAB39AQ14964 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB39AQ14964 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB39AQ14964 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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