Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
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COL4A6Q14031 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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COL4A6Q14031 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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COL4A6Q14031 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL4A6Q14031 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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