Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PDE6HQ13956 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms