Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1CQ13936 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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