Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALCAMQ13740 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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