Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CUL4BQ13620 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL4BQ13620 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms