Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TUBB3Q13509 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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