Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCIRG1Q13488 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
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