Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3FQ13275 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
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