Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF6Q13247 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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