Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
IFT88Q13099 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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IFT88Q13099 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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IFT88Q13099 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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IFT88Q13099 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFT88Q13099 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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