Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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