Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4Q12950 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms