Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF1Q12946 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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